Las tres espadas mágicas de Adol se imbuyen en los poderes elementales, usadas para destapar los secretos que se esconden en los torbellinos misteriosos que rodean la isla tropical. La vista del mundo que presenta el juego, la peculiar forma de narrar la historia, el excitante argumento y los personajes únicos hacen de Ys un título diferenciado de los demás ARPGs.
A medida que avanzas en el juego vas desbloqueando maravillosas ilustraciones ocultas y vídeos generados por ordenador que muestran la herencia de la serie Ys. Una gran banda sonora se ha compuesto también especialmente para satisfacer la naturaleza majestuosa del juego.